BigWig - геномдук серепчи трекиндеги тыгыз, үзгүлтүксүз маалыматтарды көрсөтүү үчүн файл форматы, Wiggle (WIG) форматынан конверсиялоо аркылуу түзүлгөн. BigWig форматы UCSC Genome Bioinformatics веб-сайтында сүрөттөлөт жана Broad Institute файл форматынын жетектемеси кошумча маалымат менен камсыз кылат.
BigWig формат деген эмне?
BigWig форматы график катары көрсөтүлө турган тыгыз, үзгүлтүксүз маалыматтарды көрсөтүү үчүн BigWig файлдары алгач UCSC wigToBigWig программасын колдонуу менен WIG тибиндеги файлдардан түзүлөт. Же болбосо, bigWig файлдарын bedGraph файлдарынан UCSC bedGraphToBigWig программасын колдонуу менен түзсө болот.
BigWig файлын кантип колдоном?
Жаңы түзүлгөн bigWig файлын жылдырыңыз (myBigWig.bw) желеге жеткиликтүү http, https же ftp жерине. URL дарегин ыңгайлаштырылган трек киргизүү формасына чаптаңыз же бир трек линиясын колдонуу менен жеке трек түзүңүз. Ыңгайлаштырылган трек линиясын ыңгайлаштырылган трек башкаруу барагындагы текст кутучасына чаптаңыз.
BigWig треги деген эмне?
bigWig тректери бүт геном боюнча үзгүлтүксүз сигналдар үчүн тректер. Алар ChIP-Seq сигналдары, RNA-Seq сигналдары ж.б. сыяктуу ар кандай "чийки" эксперимент натыйжаларын көрсөтүү үчүн ылайыктуу.
BigWig файлын кантип түзөм?
Чоң файлдарды түзүүнүн бир нече жолу бар. Бул, адатта, конверсияны камтыйт. bam файлын кыймылдаткыч трекке (. wig) жана андан кийин кыймылдуу тректи бинардык бигвигге (.) айландыруу
