Logo ky.boatexistence.com

Метагеномика кантип жасалат?

Мазмуну:

Метагеномика кантип жасалат?
Метагеномика кантип жасалат?

Video: Метагеномика кантип жасалат?

Video: Метагеномика кантип жасалат?
Video: Метагеномика — скрытое биоразнообразие и новые молекулы | Михаил Райко, ЦАБ СПбГУ 2024, Май
Anonim

Метагеномика экологиялык үлгү менен камтылган геномдордун түз генетикалык анализи катары аныкталат Талаа алгач экологиялык ДНКны клондоо менен башталып, андан кийин функциялык экспрессия скрининги [1], жана андан кийин айлана-чөйрөнүн ДНКсынын түз туш келди ок мылтык секвенирлөөсү менен бат толукталды [2, 3].

Метагеномика кандай процесс?

Метагеномика коомчулуктун ичиндеги бардык микроорганизмдерден ДНКны алууну камтыйт, сөзсүз түрдө катышкан түрлөрдүн баарын аныктабастан. Гендер тизмектелгенден жана аныкталган тизмектер менен салыштырылгандан кийин, бул гендердин функцияларын аныктоого болот.

Метагеномикада кандай техника колдонулат?

Микробдук жамааттын үлгүсү деңиз суусунан, чөкмөлөрдөн, кожоюн жаныбардан же башка деңиз жашоо чөйрөсүнөн алынат. Чогулган клеткалар андан кийин лизиделет жана алардын лизатынан ДНК алынат. Метагеномиканы мүмкүн кылган техника - бул секвенирлөө, ал ДНКнын туш келди аймактарын максатсыз түрдө тизмектейт.

Метагеномиканы изилдөөнүн 3 кадамы кандай?

Метагеномиканын кадамдары жана процесси:

  1. Үлгү жыйнагы:
  2. ДНК экстракциясы:
  3. Үлгү даярдоо:
  4. Үлгү анализи:

Функционалдык метагеномика кантип аткарылат?

Функционалдык метагеномика коддолгон протеиндердин функцияларын изилдөө үчүн микробдук жамааттардан ДНКны бөлүп алууну камтыйт. Ал ДНК фрагменттерин клондоону, гендерди суррогат хозисттин экспрессиясын жана ферменттик активдүүлүктөрдү скринингди камтыйт.

Сунушталууда: