BLAST – бул компьютердик алгоритм, аны Улуттук Биотехнология Маалымат Борборунун (NCBI) веб-сайтында жана башка көптөгөн сайттарда онлайн режиминде колдонууга болот. BLAST суроо ДНК ырааттуулугун ырааттуулуктун маалымат базасы менен тез тегиздеп, салыштыра алат, бул аны геномдук изилдөөлөрдүн маанилүү куралына айлантат.
BLAST негизги маалымат базасыбы?
BLAST – биоинформатиканы изилдөөдө эң кеңири колдонулган программа. Анын негизги функциясы кызыкдар ырааттуулугун, суроо ырааттуулугун чоң маалымат базасындагыBLAST ырааттуулугу менен салыштыруу, андан соң маалымат базасында табылган эң жакшы дал келүүлөрдү же "хиттерди" кабарлайт. Бул жөнөкөй программанын эки негизги колдонмосу бар.
NCBI маалымат базасыбы?
NCBI биотехнологияга жана биомедицинага тиешелүү бир катар маалымат базаларын камтыйт жана биоинформатика куралдары жана кызматтары үчүн маанилүү ресурс болуп саналат. Негизги маалымат базаларына ДНК тизмектери үчүн GenBank жана биомедициналык адабияттар үчүн библиографиялык маалымат базасы PubMed кирет. Башка маалымат базаларына NCBI Epigenomics маалымат базасы кирет.
BLAST NCBI маалымат базаларында гана колдонулабы?
BLAST желеде NCBI веб-сайтында жеткиликтүү. Суроолордун ырааттуулугуна жана максаттуу маалымат базаларына жараша ар кандай BLAST түрлөрү жеткиликтүү.
BLAST маалымат базасы кандай иштейт?
BLAST кантип иштейт? BLAST эвристикалык ыкманын жардамы менен гомологдук тизмектерди аныктайт башында эки ырааттуулуктун ортосундагы кыска дал келүүлөрдү табат; Ошентип, ыкма бүт ырааттуулук мейкиндигин эске албайт. Алгачкы дал келгенден кийин, BLAST бул баштапкы дал келүүлөрдөн жергиликтүү тегиздөөлөрдү баштоого аракет кылат.
